동림자유학교에서는 아침 8시 40분 ~ 10시 20분까지 담임교사가 진행하는 주기수업이 이루어집니다.

(9학년에서는 전문과목 선생님들께서 진행하시기도 합니다)

이 시간에는 주요과목 (국어, 수학, 형태그리기, 과학, 역사, 지리 등) 들의 수업이 이루어지며 100분간의 수업이 끝나면 20분간의 휴식과 간식 시간이 이어집니다.

  어러한 시간은 과목마다 3~4주 정도 진행되는데 하나의 과목에 집중해서 깊고 다양한 방식으로 배울 수 있습니다.

이렇게 해서 하나의 과목이 끝나면 다른 과목으로 이어지고 먼저 배운 과목은 다음 학기나 다음 해에 다시 이어서 배우게 됩니다.

이러한 체제는 인간의 기본 리듬인 잠과 깸의 리듬, 망각과 기억의 원리를 몸에 맞게 적용한 것으로 배움에서 가장 효율적인 방식이기 때문에 채택하고 있습니다.